软件工程专业于2010年开始招生。该专业培养掌握与软件系统相关的基本理论、基本知识、基本技能和基本方法，具备将基本原理与技术应用于复杂软件系统的分析、设计、验证、实现、应用、维护及开发管理的能力，具有独立实践能力、社会责任感和团队合作精神，基础实、能力强、素质高的应用型人才。

其主要课程包括程序设计技术、数据库技术、数据结构、算法分析、Web前端和服务器端应用开发技术、数字逻辑、操作系统、计算机网络、计算机组成原理、软件工程概论、Linux基础、软件体系结构、App软件开发、嵌入式系统等。

该专业是计算机类专业的基础，为其他专业方向提供学科支撑。软件工程专业是重庆市大数据智能化类特色专业，并获批重庆市一流专业建设项目。该专业的专业基础课程——《Java程序设计》——为重庆市一流课程建设项目。